Bezkomórkowa analiza DNA do nieinwazyjnego badania trisomii AD 2

Przedstawiciele sponsora przeprowadzili analizy i interpretację danych cfDNA; potrzebne były dane dotyczące wieku matki i ciąż. Pracownicy laboratorium przeprowadzili swoje analizy w sposób zaślepiony w odniesieniu do wszystkich innych danych klinicznych, w tym wyników badań ultrasonograficznych i standardowych. Pracownicy naukowi w klinikach wprowadzili dane kliniczne i laboratoryjne do elektronicznego formularza raportu, który przechowywano w bezpiecznej bazie danych. Centrum koordynujące dane opracowało i przeanalizowało dane laboratoryjne i kliniczne. Ariosa nadzorował gromadzenie danych, uczestniczył w przygotowaniu manuskryptu i zatwierdził ostateczną wersję manuskryptu. Veristat przeprowadził pierwszą analizę; analizy wtórne zostały przeprowadzone przez Ariosę. Pierwszy autor napisał pierwszą wersję manuskryptu. Wszyscy autorzy gwarantują dokładność danych i wierność badania do protokołu (dostępne z pełnym tekstem tego artykułu) i zatwierdzili przedłożenie rękopisu do publikacji. Nie było umów o poufności między autorami, stronami lub sponsorami. Badanie populacji i pobieranie próbek
Kwalifikujący się pacjenci mieli co najmniej 18 lat i mieli ciążę pojedynczą w okresie od 10,0 do 14,3 tygodnia ciąży w momencie pobierania próbki krwi. Wiek ciążowy był określany na podstawie długości korony-zrębu w czasie pomiaru przezierności karkowej.
Pacjenci nie kwalifikowali się, jeśli byli poza oknem wieku ciążowego, nie mieli standardowych wyników badań przesiewowych, znali aneuploidię lub raka u matki, poczęli z użyciem oocytów dawcy lub mieli ciążę bliźniaczą lub pustą torbę ciążową, która została zidentyfikowana w ultrasonografii . Krew obwodową zebrano w dwóch probówkach BCT bez komórek (Streck), które oznakowano unikalnym identyfikatorem pacjenta. Próbki zostały przesłane do laboratorium klinicznego Ariosa, które jest certyfikowane zgodnie z Poprawkami do Laboratorium Klinicznego, bez dalszego przetwarzania. Wyniki testów cfDNA nie były dostępne dla dostawców ani uczestników.
Metody testowania
Wszyscy pacjenci przeszli standardowe badania przesiewowe (w tym pomiar stężenia białka A w surowicy związanego z ciążą A, całkowitej lub wolnej podjednostki beta ludzkiej gonadotropiny kosmówkowej i półprzezroczystości karku) przy użyciu lokalnych laboratoriów. Wszyscy dostawcy przezroczystości karkowej byli certyfikowani przez program kontroli jakości Nuchal Translucency, Fetal Medicine Foundation lub inne krajowe programy kontroli jakości. Wykonano wszystkie pomiary przezroczystości karku oraz pobrano próbki surowicy w wieku ciążowym wymaganym przez miejscowe laboratorium.
Do oceny ryzyka klinicznego wykorzystaliśmy lokalne algorytmy ryzyka i wartości graniczne zgodnie ze standardową praktyką kliniczną. Do celów badawczych, jeden z autorów użył standardowego algorytmu5 do przeliczenia ryzyka za pomocą wielokrotności surowicy w medianie (MOM) i pomiarów przezierności karkowej i długości korony i rumpli. Dodatni wynik na standardowym badaniu przesiewowym zdefiniowano jako ryzyko w połowie trymestru, wynoszące co najmniej na 270 dla trisomii 21 i co najmniej na 150 dla trisomii 18 i trisomii 13, granice, które są powszechnie stosowane w laboratoriach w Stanach Zjednoczonych.
Szczegóły dotyczące metod testowania laboratoryjnego Ariosa opisano wcześniej.6-8 W przypadku testu cfDNA próbki odrzucono, jeśli nie zostały zebrane w probówkach BCT bez komórek; jeśli probówki zostały uszkodzone, niewypełnione lub nie oznakowane; lub jeśli próbka została rażąco zhemolizowana lub przybyła do laboratorium ponad 7 dni po pobraniu. Każda akceptowalna próbka została poddana separacji w osoczu i izolacji cfDNA, a następnie ligacji miejscowych oligonukleotydów w celu wytworzenia matrycy z wybranych loci genomowych (ryc. S1 w Dodatku uzupełniającym, dostępnym pod adresem). Oceniliśmy ryzyko aneuploidii za pomocą wcześniej opisanego algorytmu, w tym liczby cfDNA chromosomu, frakcji płodowej cfDNA i ryzyka związanego z trisomią a priori w oparciu o wiek matki i ciążę 8 (ryc. S2 w Dodatku uzupełniającym). Ryzyko na 100 lub wyższe stanowiło wyznaczony przez laboratoria próg dla zaklasyfikowania próbki jako wysokiego ryzyka. Próbki nie zostały uwzględnione w analizach, jeśli nie przeszły kontroli jakości w laboratorium ze względu na małą frakcję płodowego cfDNA (<4%), niezdolność do pomiaru frakcji płodowego cfDNA, dużą zmienność liczby cfDNA lub niepowodzenia testu .
Ciąża i noworodki
Zarejestrowaliśmy wszystkie wyniki ciąży, w tym poronienie, zakończenie i poród. Wyniki inwazyjnego prenatalnego badania diagnostycznego i testowania produktów poczęcia (tj. Poronienia) zebrano, gdy były dostępne
[przypisy: lek do inhalacji berodual, badania po poronieniach na nfz, dentysta w afryce ]

Powiązane tematy z artykułem: badania po poronieniach na nfz dentysta w afryce lek do inhalacji berodual